Реабилитация в женском центре проводится по той же методике, что и в остальных учреждениях сети Спасо-Преображенского реабилитационного центра. Методика проистекает из главного постулата: наркомания — не болезнь, а социальное зло, следствие духовной и нравственной распущенности. Поэтому лечат здесь не тело, а в первую очередь душу. Потому что снять абстинентный синдром, так называемую ломку, можно за несколько дней. А вот учить человека жить по-другому и обходиться без наркотиков подчас нужно годами.

Вновь прибывшая должна находиться в полном послушании у приставленной сестры, регулярно посещать православный храм, исповедоваться, причащаться, участвовать в богослужениях и таинствах. Иметь при себе сотовый телефон, а также деньги и иные ценности, по понятным причинам, не разрешается. Кроме того, в правилах поведения — запрет на азартные игры, нецензурную брань, насилие и самовольные отлучки.

Первые семь дней — карантин, чтобы будущая послушница очистилась от наркотиков физиологически. Затем начинается долгая духовная реабилитация. Всё это время женщины находятся под присмотром руководителя центра и посещающих их матушек — жён священнослужителей. В свободное время они смотрят православные фильмы, читают Евангелие и Псалтирь, общаются со священниками и психологами. Через полгода, когда послушница окрепнет, можно приступать и к трудотерапии. Это и ведение сельского хозяйства, и уход за домашними животными, и работа при храме и монастыре, и многое другое.

Всего программа реабилитации рассчитана на период от года до полутора лет. И как показывает практика, процент тех, кто возвращается к нормальной жизни, достаточно высок, и не идет ни в какое сравнение с результатами и достижениями официальной, медицинской наркологии.
Программа социальной реабилитации наркозависимых, применяемая в Спасо-Преображенском центре, по мнению руководства российского Госнаркоконтроля признана лучшей в России. Центр сертифицирован Научно-исследовательским Центром ФСКН России. Он получил всероссийское признание и его опыт рекомендован для изучения и распространения на всей территории
страны. За годы работы здесь прошли реабилитацию почти две тысячи человек, из них успешно — почти две трети. Восстановлены сотни семей. Люди вернулись к нормальной жизни, нашли работу, помогают спастись другим. Какой медицинский реабилитационный центр может похвастаться такими результатами?